شوکان با تعداد زیادی از همراهانش به زمین حمله میکند و حالا وظیفه مقابله با آنها بر دوش ریدن ، لیوکنگ و ... هست. این فیلم ادامه داستان Mortal Kombat The Movie 1995 است که کرکتر های زیادی به آن اضافه شده اند.